Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TefQ9JLC6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefQ9JLC6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms