Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CubnQ9JLB4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms