Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod2Q9JKK7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod2Q9JKK7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms