Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cyp39a1Q9JKJ9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.3 ms