Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uchl3Q9JKB1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms