Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tuba8Q9JJZ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tuba8Q9JJZ2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms