Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gfra4Q9JJT2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms