Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scube2Q9JJS0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scube2Q9JJS0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms