Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfhx4Q9JJN2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms