Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcirg1Q9JHF5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms