Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim2Q9ESN6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms