Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim54Q9ERP3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim54Q9ERP3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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