Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lima1Q9ERG0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lima1Q9ERG0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lima1Q9ERG0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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