Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Clstn2Q9ER65 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms