Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn12Q9ER56 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms