Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rhox9Q9EQM5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhox9Q9EQM5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms