Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndst3Q9EQH7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ndst3Q9EQH7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms