Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms