Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Mlst8Q9DCJ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms