Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trmt112Q9DCG9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trmt112Q9DCG9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms