Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Xab2Q9DCD2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms