Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf6Q9DBU5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf6Q9DBU5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms