Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms