Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Znf580Q9DB38 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Znf580Q9DB38 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Znf580Q9DB38 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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