Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Pop5Q9DB28 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Pop5Q9DB28 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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