Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cnn3Q9DAW9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms