Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smco2Q9DA21 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smco2Q9DA21 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms