Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Calr3Q9D9Q6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Calr3Q9D9Q6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms