Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Snx5Q9D8U8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Snx5Q9D8U8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Snx5Q9D8U8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Snx5Q9D8U8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Snx5Q9D8U8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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