Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SlirpQ9D8T7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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