Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gtf3c6Q9D8P7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gtf3c6Q9D8P7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gtf3c6Q9D8P7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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