Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifi35Q9D8C4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifi35Q9D8C4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms