Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Capn9Q9D805 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms