Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Q9D7E4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q9D7E4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms