Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms