Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc94Q9D6J3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms