Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfn4Q9D6I3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms