Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sdr42e1Q9D665 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sdr42e1Q9D665 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms