Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec23bQ9D662 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec23bQ9D662 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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