Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11fip1Q9D620 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms