Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gins2Q9D600 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms