Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms