Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PrameQ9D4Z5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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