Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tubgcp4Q9D4F8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tubgcp4Q9D4F8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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