Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Syce1Q9D495 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms