Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx29Q9D3S3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms