Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rufy3Q9D394 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms