Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pramef12Q9D2F1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms