Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spns3Q9D232 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Spns3Q9D232 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Spns3Q9D232 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spns3Q9D232 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms