Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chordc1Q9D1P4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms